Uteklo několik let a Šin Hajata, současný ministr obrany, si nepamatuje, že se stal Ultramanem a zachránil svět před mimozemskými monstry. Jeho přítel ze Science Patrol, Macuširo Ide, se mu snaží vzpomínky vrátit, aby mohl Science Patrol pomoci eliminovat další mimozemské hrozby. Když mimozemšťan Bemular zjistí, že Hajatův syn Sindžiró začíná projevovat nadlidskou sílu, riskuje Science Patrol všechno. Dá Sindžiróvi přísně střežený ultraoblek, aby mohl Bemulara porazit a zachránit svět.