Vyznamenaný agent CIA Jake Alexander se plně věnuje mýcení zločinu v jihovýchodní Asii jednak proto, že je zvyklý pracovat naplno, jednak proto, že si svůj nový domov zamiloval. Při misi, jejímž cílem bylo zastavit organizaci obchodující s lidskými orgány, přijde Jake o důležitého člena týmu Zacha Stevense, který byl při pokusu o infiltraci zabit. Když o tom Alexander podá hlášení, jeho dlouhodobá řídící důstojnice Jessica Thompsonová ho informuje, že případ obchodníka s orgány je v důsledku této nešťastné události uzavřen a jeho tým bude převelen do jiné části světa. Alexander a členové jeho týmu, frustrovaní z toho, že vrah unikne spravedlnosti, se dohodnou, že se případu nevzdají, dokud Stevensova vraha nedostanou.
Během natáčení scén pro film General Commander předělal hlavní herec Steven Seagal také některé scény ve filmu Attrition, který se rovněž odehrával na Filipínách.
General Commander byl původně zamýšlen a uváděn na trh jako televizní seriál o "přísně tajné mezinárodní polovojenské jednotce, která bojuje proti velkým zločineckým organizacím ve snaze zastavit třetí světovou válku" podle scénáře Philipa Martineze a Bey Logana a v produkci společností SPI International a Saradan Media. Seriál měl mít devět dílů, každý o délce 45 minut.