Členové pionýrského loutkářského souboru připravují představení o cestě na Měsíc. Jejich snažení nenápadně pozoruje Pepík Barnabáš, který ovšem nehraje divadlo, protože se považuje za detektiva. Když se dětem ztratí kufr s loutkami, je to právě Pepík, kdo se stane prvním podezřelým. Děti ho pronásledují, ale když jej dopadnou, ukáže se, že Pepík u sebe kufr nemá. Chlapec se nabídne, že dětem pomůže ztracené věci najít.
Film 'Případ Lupínek' byl jedním z prvních, kde se Václav Vorlíček pokusil o kombinaci detektivního žánru s komediálními prvky.
'Případ Lupínek' byl jedním z prvních filmů, kde Václav Vorlíček spolupracoval s kameramanem Josefem Illíkem, s nímž později vytvořil mnoho dalších úspěšných filmů.
Film 'Případ Lupínek' je jedním z prvních filmů režiséra Václava Vorlíčka, který se později proslavil svými komediemi a pohádkami.