Hlavním hrdinou seriálu Dobrý doktor je MUDr. Shaun Murphy, mladý chirurg s autismem a syndromem učence. Shaun se právě přestěhoval z klidného venkova na chirurgické oddělení prestižní nemocnice svatého Bonaventury. Ačkoli se nedokáže osobně sblížit se svým okolím, využívá svého mimořádného lékařského nadání k záchraně životů a zpochybňuje skepsi svých kolegů